Son siete las municipalidades en las cuales se encierra la cuenca del río Carapá. A ejemplo de lo que se verificó en el Proyecto Yrembe en que fueron seleccionadas dos microcuencas para que sirvan como piloto de las microcuencas cinturón, una microcuenca de cada municipalidad será electa como microcuenca piloto de aquel territorio.

Esas microcuencas piloto serán objeto de estudio más profundizado en sus aspectos físico, biológico y antrópico, de manera que la planificación de las mismas y, sobre todo la intervención en ellas guarden estrecha relación con el estado de ánimo y con los recursos de las poblaciones locales.

El Proyecto Carapã Ypoti espera valerse de los segmentos ambientalistas en ella existentes para la implementación de las actividades electas para ser realizadas, apoyándolos con asistencia técnica, organizacional y otros incentivos posibles.